Berdasarkan doktrin Quirk Doomsday Theory, kelompok ideologi Humarise yakin bahwa semua manusia yang memiliki quirk adalah penyakit dan harus dibasmi. Untuk membangun kembali dunia, para ekstremis kelompok tersebut telah membangun sebuah alat mematikan yang dikenal sebagai “Bom Pemicu” yang menyebabkan orang-orang yang memiliki keunikan kehilangan kendali dan mati. Pemimpin mereka, Flect Turn, menghindari penangkapan dari Pahlawan Pro yang dikerahkan di seluruh dunia.
Selama studi kerjanya di negara Otheon bersama Pro Hero nomor satu Jepang, Izuku “Deku” Midoriya dituduh melakukan kejahatan yang tidak dilakukannya. Tanpa sengaja melibatkan Roddy Soul, warga setempat, Deku segera kabur bersama bocah itu. Sekarang bergantung pada Rody, Deku, dan teman-teman sekelas Deku untuk menghentikan plot Trigger Bomb yang dijalankan oleh Flect, sambil menghindari anggota Humarise yang gigih lainnya.
